ここしばらくFlashの脆弱性情報が気になっていたので、うまいことブラウザの設定で多少安全に使えないか調べていました。

OperaでのFlashを含むプラグイン全般の設定は、　設定→ウェブサイト→プラグイン　で行います。
プラグインの実行設定は

・すべてのプラグインのコンテンツを実行する
・重要なプラグインのコンテンツを検知して実行する
・クリックして再生する
・デフォルトでプラグインを実行しない

の4種類が用意されています。
この他に　例外の管理　が可能で、こちらの設定ではドメインごとにプラグインを実行するか否かを設定できます。
最大の防御力を得ようとするなら　デフォルトでプラグインを実行しない　を選んで必要なドメインのみ例外で許可するのが良いと思いますが、
いちいちドメインのリストを作るのも面倒なので　クリックして再生する　に設定することにしました。

ちょうどGoogle ChromeのFlash広告自動再生停止のような感じになります。
必要なものであればクリックするだけで見られるのでこのくらいの設定が好バランスなのではないかと思います。